棉属转座子变异图谱构建成功

近日，中国棉花研究所棉花功能基因组创新团队构建了棉属转座子变异图谱，揭示了转座子活动在现代棉花培育过程中的重要作用。相关研究成果发表在《高级研究期刊（Journal of Advanced Research）》上。 转座子又称跳跃基因，是指一段可以从原位上单独复制或断裂下来，环化后插入另一位点并对其后的基因起调控作用的DNA序列。转座子活动是生物基因组创新的重要驱动力。在棉花中，关于转座子的研究大多集中于讨论转座子对棉属基因组扩张及分化的影响，而关于转座子活动对现代棉花培育的影响则研究较少。 该研究以已发表的10个棉花基因组为基础，构建了包含35980个转座子活动在内的图形化棉属转座子变异组，并进行了转座子活动的甲基化程度评估。研究发现，棉花基因组上最新插入的转座子具有较低的甲基化水平，表明育种活动能够影响转座子的表观遗传特征。此外，该研究解析了棉属转座子活动对现代陆地棉品种培育的影响，鉴定到了与棉种地理适应性相关的转座子活动，并发现了这些转座子活动的多效性。研究结果为棉花分子育种提供了丰富的数据资源。 该研究得到中国科技创新工程等项目的支持。（通讯员 梁冰） 原文链接：https://doi.org/10.1016/j.jare.2024.05.019